São Francisco é uma ilha, cujo centro histórico está debruçado às margens da Baía da Babitonga. Além de São Francisco, ficam na Baía outras duas dezenas de ilhas. Sua característica de grande enseada abrigada permite a navegação durante o ano inteiro - não por acaso, os maiores clubes de pesca embarcada são da região.

São Francisco é cidade histórica, com mais de 150 casas e monumentos tombados pelo patrimônio histórico. Tem, ainda, uma dúzia de praias bastante freqüentadas durante o verão, com destaque para a Enseada.

Ao Sul de São Francisco, ficam Barra do Sul, Barra Velha e Piçarras, vilarejos pacatos de pescadores, com suas praias bonitas e o colorido dos barcos de pesca.